Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SMG9Q9H0W8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SMG9Q9H0W8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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