Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCDC8Q9H0W5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CCDC8Q9H0W5 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms