Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RSPH6AQ9H0K4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RSPH6AQ9H0K4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms