Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GFRA4Q9GZZ7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms