Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM39BQ9GZU3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM39BQ9GZU3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM39BQ9GZU3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms