Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLIRPQ9GZT3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms