Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CEP44Q9C0F1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CEP44Q9C0F1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms