Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM8Q9BZR9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM8Q9BZR9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms