Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BARHL1Q9BZE3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BARHL1Q9BZE3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms