Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDHR2Q9BYE9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDHR2Q9BYE9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms