Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOL6Q9BWW8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APOL6Q9BWW8 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms