Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG4

SSBP4, Single-stranded DNA-binding protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4Q9BWG4 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SSBP4Q9BWG4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SSBP4Q9BWG4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms