Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TRAF4Q9BUZ4 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms