Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RSG1Q9BU20 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RSG1Q9BU20 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms