Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEMA3CQ99985 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEMA3CQ99985 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms