Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CITED1Q99966 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CITED1Q99966 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms