Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
SIN3AQ96ST3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SIN3AQ96ST3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms