Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT7

TUBGCP6, Gamma-tubulin complex component 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP6Q96RT7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TUBGCP6Q96RT7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TUBGCP6Q96RT7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms