Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ALS2Q96Q42 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ALS2Q96Q42 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms