Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC85AQ96PX6 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC85AQ96PX6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms