Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CCDC138Q96M89 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.3 ms