Protein–RNA interactions for Protein: Q96M42

LINC00479, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00479, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00479Q96M42 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LINC00479Q96M42 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms