Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GJD4Q96KN9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GJD4Q96KN9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms