Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC34Q96HJ3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC34Q96HJ3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms