Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CRELD1Q96HD1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRELD1Q96HD1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms