Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
BCANQ96GW7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
BCANQ96GW7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCANQ96GW7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCANQ96GW7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCANQ96GW7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCANQ96GW7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCANQ96GW7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCANQ96GW7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
BCANQ96GW7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms