Protein–RNA interactions for Protein: Q96G21

IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4Q96G21 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IMP4Q96G21 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IMP4Q96G21 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMP4Q96G21 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IMP4Q96G21 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms