Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OTUB2Q96DC9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
OTUB2Q96DC9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms