Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
KCTD12Q96CX2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms