Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC102AQ96A19 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC102AQ96A19 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms