Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

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Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
USP7Q93009 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
USP7Q93009 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP7Q93009 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP7Q93009 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP7Q93009 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP7Q93009 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP7Q93009 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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USP7Q93009 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
USP7Q93009 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
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USP7Q93009 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP7Q93009 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP7Q93009 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP7Q93009 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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USP7Q93009 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP7Q93009 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
USP7Q93009 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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USP7Q93009 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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USP7Q93009 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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USP7Q93009 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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USP7Q93009 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
USP7Q93009 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
USP7Q93009 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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