Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PRG4Q92954 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PRG4Q92954 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms