Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GTF3AQ92664 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms