Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSPC1Q8WXF1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSPC1Q8WXF1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
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