Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRPF31Q8WWY3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRPF31Q8WWY3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms