Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CSNK2A3Q8NEV1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CSNK2A3Q8NEV1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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