Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
BHLHE23Q8NDY6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
BHLHE23Q8NDY6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms