Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CARMIL3Q8ND23 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CARMIL3Q8ND23 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CARMIL3Q8ND23 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms