Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMEM229BQ8NBD8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TMEM229BQ8NBD8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms