Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP38Q8NB14 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP38Q8NB14 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms