Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms