Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5R6

CCDC33, Coiled-coil domain-containing protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33Q8N5R6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CCDC33Q8N5R6 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC33Q8N5R6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms