Protein–RNA interactions for Protein: Q8N511

TMEM199, Transmembrane protein 199, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM199Q8N511 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM199Q8N511 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM199Q8N511 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms