Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SVOPQ8N4V2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SVOPQ8N4V2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms