Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4XQ8N0W4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4XQ8N0W4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4XQ8N0W4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4XQ8N0W4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4XQ8N0W4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4XQ8N0W4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4XQ8N0W4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4XQ8N0W4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NLGN4XQ8N0W4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NLGN4XQ8N0W4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NLGN4XQ8N0W4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms