Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRRC8AQ8IWT6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRC8AQ8IWT6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms