Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
P3H3Q8IVL6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
P3H3Q8IVL6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms