Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PHF13Q86YI8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PHF13Q86YI8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms