Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPFIBP1Q86W92 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PPFIBP1Q86W92 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms