Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PBRM1Q86U86 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PBRM1Q86U86 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PBRM1Q86U86 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PBRM1Q86U86 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
PBRM1Q86U86 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PBRM1Q86U86 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
PBRM1Q86U86 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
PBRM1Q86U86 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms